Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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