Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TfamP40630 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TfamP40630 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TfamP40630 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TfamP40630 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TfamP40630 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TfamP40630 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms