Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VhlP40338 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VhlP40338 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VhlP40338 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VhlP40338 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms