Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik2P39087 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms