Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetP35546 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetP35546 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetP35546 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetP35546 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetP35546 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RetP35546 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RetP35546 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RetP35546 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RetP35546 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetP35546 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetP35546 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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