Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms