Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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