Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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