Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms