Protein–RNA interactions for Protein: P30549

Tacr2, Substance-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr2P30549 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr2P30549 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr2P30549 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms