Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tacr1P30548 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tacr1P30548 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms