Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms