Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprmP28828 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprmP28828 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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