Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BgnP28653 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BgnP28653 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BgnP28653 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BgnP28653 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BgnP28653 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BgnP28653 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BgnP28653 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BgnP28653 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BgnP28653 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BgnP28653 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BgnP28653 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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