Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja4P28235 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms