Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms