Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Xrcc5P27641 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Xrcc5P27641 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Xrcc5P27641 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Xrcc5P27641 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Xrcc5P27641 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Xrcc5P27641 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Xrcc5P27641 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Xrcc5P27641 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc5P27641 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Xrcc5P27641 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms