Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms