Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms