Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Psph-202ENSMUST00000118268 785 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms