Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms