Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmbsP22907 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmbsP22907 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms