Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms