Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcb1aP21447 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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