Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VimP20152 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VimP20152 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VimP20152 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VimP20152 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VimP20152 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VimP20152 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VimP20152 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VimP20152 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VimP20152 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VimP20152 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VimP20152 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VimP20152 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms