Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P20040 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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P20040 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P20040 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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P20040 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P20040 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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P20040 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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P20040 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P20040 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P20040 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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