Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NefhP19246 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NefhP19246 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NefhP19246 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NefhP19246 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms