Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms