Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpraP18052 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpraP18052 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtpraP18052 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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