Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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