Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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