Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms