Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Irf1P15314 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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