Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms