Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lire1P11260 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lire1P11260 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms