Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms