Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms