Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms