Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtrP07309 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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TtrP07309 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtrP07309 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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