Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa4P06798 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms