Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P06320 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P06320 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P06320 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P06320 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P06320 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P06320 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P06320 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P06320 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P06320 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P06320 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P06320 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms