Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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