Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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