Protein–RNA interactions for Protein: P03899

Mtnd3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd3P03899 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd3P03899 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms