Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt10P02535 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt10P02535 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt10P02535 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms