Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01656 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01656 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01656 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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