Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01654 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01654 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01654 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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