Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01644 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01644 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01644 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01644 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms