Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms