Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cd160O88875 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd160O88875 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms